Descrição
Leituras de sequenciamento Illumina podem ser aparadas e filtradas antes de análises bioinformáticas posteriores. Esta ferramenta Java de linha de comando remove adaptadores, bases de baixa qualidade e leituras que não atingem limites configurados.
Use `trimmomatic` em pipelines de sequenciamento com arquivos explícitos de entrada e saída. Ela grava dados FASTQ derivados, então mantenha as leituras originais intactas e verifique parâmetros de trimming antes de grandes lotes.