Descrição
Dados de sequenciamento de nova geração em BAM e formatos relacionados conseguem ser processados com uma suíte de ferramentas do Broad Institute. Estas ferramentas de linha de comando são úteis para pipelines de bioinformática que marcam duplicatas, manipulam grupos de leitura, validam arquivos e preparam dados de sequenciamento. Elas rodam em terminal com o comando picard e subcomandos. Dados genômicos podem ser sensíveis, então caminhos de entrada, identificadores de amostras, logs e saídas compartilhadas precisam de revisão de privacidade.