Descrição
Avogadro é um sistema de modelagem e gráficos moleculares para moléculas e biomoléculas. Pode visualizar propriedades como orbitais moleculares ou potenciais eletrostáticos e tem um construtor molecular intuitivo.
Inclui os seguintes recursos: * Modelador molecular com otimização automática de geometria baseada em campo de força; * Mecânica molecular incluindo restrições e buscas de confórmeros; * Visualização de orbitais moleculares e isosuperfícies gerais; * Visualização de vibrações e plotagem de espectro vibracional; * Suporte para células unitárias cristalográficas; * Geração de entrada para os pacotes de química quântica Gaussian, GAMESS e MOLPRO; * Arquitetura de extensões flexível e scripts em Python.
Os formatos de arquivos que o Avogadro pode ler incluem PDB, XYZ, CML, CIF, Molden, assim como a saída dos pacotes Gaussian, GAMESS e MOLPRO.